Исчезновение Харухи Судзумии

Наступает середина декабря, и атмосфера праздника окутывает школу. Глава клуба [[SOS]] Судзумия Харухи [涼宮 ハルヒ] решает, что Рождество будет проведено в комнате клуба с рождественским ужином. Все члены SOS бросаются в приготовления, наполняя комнату праздничным настроением. Однако, за кулисами этих приготовлений скрываются странные события, которые незаметно начинают происходить вокруг Кёна.

Проходит несколько дней, и Кён замечает, что мир вокруг него начинает меняться. Разговоры с Танигути становятся невнятными, а тот внезапно заболевает и не помнит вчерашних бесед. В классе нет Харухи, а Рёко Асакура, казалось бы, воскресает и занимает её место, разговаривая с Кёном как будто ничего не произошло. Микуру Асахина не узнает Кёна, а Нагато [長門 有希] превращается в обычную девушку, единственную представительницу литературного клуба.

Кён понимает, что ни бригады SOS, ни Судзумии Харухи в этой школе никогда не существовало. Мир, который он знал, рассыпался, оставив лишь пустоту и загадки. Теперь ему предстоит разгадать тайну этого странного мира и найти способ вернуть всё на свои места, прежде чем праздник окончательно потеряет свой смысл.